Mission Bio Tapestri单细胞多组学平台
时间:2021/7/7
Mission Bio Tapestri平台是目前唯一的单细胞DNA+蛋白高通量分析平台,该平台基于基因组靶向扩增子技术和表面蛋白抗体标签测序技术,能在单细胞水平同时分析基因组和蛋白组的差异变化,基于革新的两步微流控和多重PCR技术,每次最多可以分析1000个扩增子和45种表面蛋白。既可以使用验证过的基因位点组合,也可以自由定制所需的基因位点和表面蛋白组合,可以精确地获得每个细胞内突变位点信息以及整个细胞群体的细胞组成。
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Mission Bio Tapestri平台的基本原理包括两个步骤,第一步是通过第一级微流控管路,将细胞裂解试剂和细胞包裹到一个油包水液滴内,并在液滴内对细胞进行裂解;第二步是通过第二集微流控管路,将第一步获得的液滴和带有细胞标签的微珠再次包裹进一个更大的油包水液滴内,将第一步的液滴裂解,释放DNA,微珠上的引物捕获目的片段,通过PCR扩增给目的片段加上细胞标签,最后是对PCR产物构建文库,上机测序后使用标准的分析流程进行分析和结果可视化。
若要同步进行单细胞基因组和表面蛋白标志的分析,在细胞上机之前,需要使用携带有特殊标签的抗体与细胞进行孵育,孵育完成后上机完成细胞的裂解、基因组DNA及蛋白标签的标记和PCR,在后续文库构建过程中分别建库,获得基因组和蛋白组两个测序文库,在分析完成后将带有同样细胞标签的数据合并为同一个细胞的数据。

除此以外,该平台还可以同时进行单细胞DNA甲基化及表面蛋白的测序分析,其原理是在第二级微流控引入CpG敏感性内切酶,建立DNA甲基化特征文库,并可以与单细胞突变特征和表面蛋白文库整合分析,单次实验可同时检测10000个细胞中高达650个CpG位点。
Mission Bio Tapestri平台目前在肿瘤学领域应用最为广泛,包括血液肿瘤及实体瘤的克隆谱系追踪、药物敏感性预测、MRD监测、突变协同作用等研究和应用方向。除此以外,在基因编辑、免疫治疗靶点筛选等研究领域也有广阔的应用前景。可以说,任何存在单细胞基因组异质性的疾病模型内,Mission Bio Tapestri平台都是目前最佳解决方案,是单细胞多组学技术中的最重要环节,是单细胞转录组、表观组测序结果的根源体现,它将极大地提升研究价值,加速研究进展。
